Misją Stowarzyszenia jest upowszechnianie rolnictwa ekologicznego, ekologicznej produkcji i zdrowego trybu życia. Za swój cel organizacja uznaje również promocję Lubelszczyzny jako regionu dbającego o czystość środowiska i oferującego coraz atrakcyjniejszy zestaw naturalnych produktów spożywczych o tradycyjnym, polskim smaku. Stowarzyszenie udziela pomocy merytorycznej rolnikom oraz przetwórcom pragnącym podjąć ekoprodukcję lub nawiązać nowe kontakty biznesowe. Członkami EkoLubelszczyzny są zarówno przetwórcy żywności, organizacje rolnicze, handlowcy, jak i członkowie organizacji doradztwa rolniczego, biznesmeni oraz naukowcy. Współpraca w ramach Stowarzyszenia obejmuje organizowanie szkoleń, konferencji, seminariów, kiermaszów żywności ekologicznej, wydawanie wspólnych publikacji, a także starania o europejskie środki finansowe.